Revolucionarno genetsko istraživanje: Nova metoda za analizu bakterija u Würzburgu

Revolucionarno genetsko istraživanje: Nova metoda za analizu bakterija u Würzburgu

Dana 8. svibnja 2025. istraživački tim sa Sveučilišta Julius Maximilian u Würzburgu, zajedno s Institutom Helmholtz za istraživanje infekcija temeljenih na RNK (HIRI), predstavio je revolucionarnu metodu za analizu aktivnosti gena u bakterijskim kolonijama. Ova inovacija, poznata kao bakterijski MATQ-seq, predstavlja poboljšani oblik jednostanične transkriptomike usmjerene na produbljivanje razumijevanja raznolikosti unutar bakterijskih populacija, posebno u pogledu patogena. Nova metoda omogućuje snimanje mRNA molekula pojedinih bakterijskih stanica i na taj način identificiranje aktivnih gena, što je od velike važnosti za medicinska istraživanja. Glasno uni-wuerzburg.de Proces ima izvanrednu stopu zadržavanja stanica od 95%, što ga izdvaja od tradicionalnih metoda gdje su stope gubitka do 70% uobičajene.

Studija naglašava da se nova tehnika može koristiti za analizu između 300 i 600 gena po bakterijskoj stanici. Cijeli proces stvaranja tih jednobakterijskih transkriptoma traje oko pet dana i posebno je prikladan za manje uzorke koji uključuju stotine stanica. Međutim, za veće uzorke sa stotinama tisuća do milijunima stanica potrebni su drugačiji protokoli, ali su često podložni većim gubicima i manjoj pokrivenosti gena.

Nova istraživačka platforma u Würzburgu

Kao dio ovog razvoja, Centar za mikrobnu jednostaničnu RNA-seq (MICROSEQ) bit će postavljen u Würzburgu. Cilj ove platforme je učiniti tehnologije i stručnost dostupnima istraživačkim skupinama diljem svijeta. MICROSEQ je dio Würzburškog jednostaničnog centra, koji također nudi analizu transkriptoma pojedinačnih eukariotskih stanica. Napredak u genetskoj analizi predstavlja i tehnološki napredak i odgovor na prethodne izazove u sekvenciranju jednostanične RNA, koji su često uzrokovani manjom veličinom stanica bakterija u usporedbi s eukariotima, kao i poteškoćama u lizi stanica i otkrivanju bakterijskih transkripata.

Važnost ove metode nije samo znanstvena, već ima i praktične implikacije za medicinska istraživanja. Omogućuje dublji uvid u aktivnost stanica u normalnim uvjetima, u bolestima i kao odgovor na lijekove. Glasno priroda.com Poboljšanja postignuta ovom tehnologijom također su prikazana u brojnim studijama koje pokazuju važnost visoke pokrivenosti gena i detekcije regulacijskih malih RNA na razini jedne stanice.

Validacija i područja primjene

Nova MATQ-seq tehnika pokazuje uspješnu validaciju na salmonelu pod različitim uvjetima rasta i dovodi do povećane robusnosti protokola i smanjene stope neuspjeha u čitanju genetskih informacija. To donosi značajna poboljšanja u kvaliteti podataka važnih u proučavanju bakterijskih fenotipova. Takve fenotipske heterogenosti ključne su za razumijevanje načina na koji se bakterije prilagođavaju različitim okruženjima.

Izvorna objava rezultata bila je u časopisu mBio i pokazala je da je metoda prikladna za eksperimente s ograničenim početnim materijalom. To omogućuje detaljno proučavanje subpopulacija malih bakterijskih stanica u nišama domaćina, što bi moglo biti važno i za razvoj novih terapijskih strategija. helmholtz-hiri.de naglašeno.