Revoliuciniai genetiniai tyrimai: naujas bakterijų analizės metodas Viurcburge

Revoliuciniai genetiniai tyrimai: naujas bakterijų analizės metodas Viurcburge

2025 m. gegužės 8 d. Viurcburgo Juliaus Maksimiliano universiteto tyrimų grupė kartu su Helmholtzo RNR pagrįstų infekcijų tyrimų institutu (HIRI) pristatė novatorišką metodą, skirtą genų aktyvumui bakterijų kolonijose analizuoti. Ši naujovė, žinoma kaip bakterinė MATQ-seq, yra patobulinta vienos ląstelės transkriptomikos forma, orientuota į bakterijų populiacijų įvairovės supratimą, ypač atsižvelgiant į patogenus. Naujasis metodas leidžia fiksuoti atskirų bakterijų ląstelių mRNR molekules ir taip identifikuoti aktyvius genus, o tai turi didelę reikšmę medicininiams tyrimams. Garsiai uni-wuerzburg.de Šis procesas pasižymi puikiu 95% ląstelių sulaikymo rodikliu, kuris išskiria jį iš tradicinių metodų, kai įprastas praradimas siekia 70%.

Tyrimas pabrėžia, kad naujas metodas gali būti naudojamas analizuoti nuo 300 iki 600 genų vienoje bakterijų ląstelėje. Visas šių vienos bakterijos transkriptų kūrimo procesas trunka apie penkias dienas ir yra ypač tinkamas mažesniems mėginiams, kuriuose yra šimtai ląstelių. Tačiau didesniems mėginiams, kuriuose yra nuo šimtų tūkstančių iki milijonų ląstelių, reikalingi skirtingi protokolai, tačiau dažnai patiriami didesni nuostoliai ir mažesnė genų aprėptis.

Nauja tyrimų platforma Viurcburge

Vykdant šią plėtrą Viurcburge bus įkurtas Mikrobų vienaląsčių RNR-seq centras (MICROSEQ). Šia platforma siekiama, kad technologijos ir žinios būtų prieinamos mokslinių tyrimų grupėms visame pasaulyje. MICROSEQ yra Würzburg Single-Cell Center, kuris taip pat siūlo atskirų eukariotinių ląstelių transkripto analizę, dalis. Genetinės analizės pažanga rodo ir technologinę pažangą, ir atsaką į ankstesnius vienos ląstelės RNR sekos nustatymo iššūkius, kuriuos dažnai sukelia mažesnis bakterijų ląstelių dydis, palyginti su eukariotais, taip pat sunkumai, susiję su ląstelių lize ir bakterijų transkriptų aptikimu.

Šio metodo svarba yra ne tik mokslinė, bet ir turi praktinės reikšmės medicininiams tyrimams. Tai leidžia giliau suprasti ląstelių veiklą normaliomis sąlygomis, sergant ligomis ir reaguojant į vaistus. Garsiai nature.com Patobulinimai, pasiekti naudojant šią technologiją, taip pat rodomi daugybėje tyrimų, rodančių didelės genų aprėpties ir reguliuojančių mažų RNR aptikimo vienos ląstelės lygmeniu svarbą.

Patvirtinimas ir taikymo sritys

Naujasis MATQ-seq metodas rodo sėkmingą Salmonella patvirtinimą skirtingomis augimo sąlygomis ir padidina protokolo tvirtumą bei sumažina genetinės informacijos skaitymo nesėkmių skaičių. Tai žymiai pagerina duomenų, svarbių tiriant bakterijų fenotipus, kokybę. Tokie fenotipiniai skirtumai yra labai svarbūs norint suprasti, kaip bakterijos prisitaiko prie skirtingos aplinkos.

Pirminis rezultatų paskelbimas buvo žurnale mBio ir parodė, kad metodas tinka eksperimentams su ribota pradine medžiaga. Tai leidžia išsamiai ištirti mažas bakterijų ląstelių subpopuliacijas šeimininkų nišose, kurios taip pat gali būti svarbios kuriant naujas gydymo strategijas. helmholtz-hiri.de pabrėžė.