革命性的基因研究:维尔茨堡分析细菌的新方法
JMU Würzburg 和 HIRI 正在开发一种创新的单细胞转录组学方法来分析细菌基因活性。

革命性的基因研究:维尔茨堡分析细菌的新方法
2025 年 5 月 8 日,维尔茨堡朱利叶斯·马克西米利安大学的一个研究小组与亥姆霍兹 RNA 感染研究所 (HIRI) 合作,提出了一种分析细菌菌落基因活性的突破性方法。这项创新被称为细菌 MATQ-seq,代表了单细胞转录组学的改进形式,专注于加深对细菌种群多样性的理解,特别是在病原体方面。新方法使得记录单个细菌细胞的mRNA分子从而识别活性基因成为可能,这对于医学研究具有重要意义。大声 维尔茨堡大学.de 该过程的细胞保留率高达 95%,这与传统方法的损失率高达 70% 的现象截然不同。
该研究强调,新技术可用于分析每个细菌细胞 300 至 600 个基因。创建这些单细菌转录组的整个过程大约需要五天,特别适合包含数百个细胞的较小样品。然而,对于包含数十万到数百万个细胞的较大样本,需要不同的方案,但往往会遭受更高的损失和更低的基因覆盖率。
维尔茨堡的新研究平台
作为该开发的一部分,微生物单细胞 RNA 测序中心 (MICROSEQ) 将在维尔茨堡设立。该平台旨在为世界各地的研究小组提供技术和专业知识。 MICROSEQ 是维尔茨堡单细胞中心的一部分,该中心还提供单个真核细胞的转录组分析。遗传分析的进步既代表了技术进步,也代表了对单细胞RNA测序先前挑战的回应,这些挑战通常是由于细菌的细胞尺寸比真核生物更小,以及细胞裂解和细菌转录本检测的困难造成的。
这种方法的重要性不仅是科学性的,而且对医学研究也具有实际意义。它可以更深入地了解正常条件、疾病和药物反应下的细胞活动。大声 自然网 大量研究也证明了该技术所取得的进步,表明高基因覆盖率和在单细胞水平上检测调节性小 RNA 的重要性。
验证和应用领域
新的 MATQ-seq 技术在不同生长条件下成功验证了沙门氏菌,并提高了协议的稳健性并降低了读取遗传信息的失败率。这显着提高了细菌表型研究中重要的数据质量。这种表型异质性对于了解细菌如何适应不同环境至关重要。
该结果最初发表在《mBio》杂志上,表明该方法适用于起始材料有限的实验。这使得能够对宿主生态位中的小细菌细胞亚群进行详细研究,这对于新治疗策略的开发也很重要 亥姆霍兹希尔德 强调。