Nākotnes augu izpēte: inovācija, izmantojot digitālo datu pārvaldību

Nākotnes augu izpēte: inovācija, izmantojot digitālo datu pārvaldību

Ar mērķi nodrošināt pārtiku augošajam pasaules iedzīvotāju skaitam, DataPLANT konsorcijam ir būtiska ietekme uz augu izpēti. Šī konsorcija uzdevums ir padarīt milzīgus augu pētījumu datu apjomus izmantojamus un salīdzināmus. Pētnieki no dažādām disciplīnām sadarbojas, lai analizētu ģenētisko daudzveidību un molekulāros principus, kas nosaka augšanu, ražu un biomasas ražošanu. Par finansējumu lēma Apvienotā zinātnes konference (GWK) pēc Vācijas Pētniecības fonda (DFG) ieteikuma līdz 2028. gada beigām, kas apliecina pētījumu ilgtspēju un atbilstību. Saskaņā ar RPTU Pētījuma mērķis ir uzlabot izpratni par augu dzīvi. Tas notiek arī uz globālo pārtikas drošības problēmu fona.

Galvenais pētniecības aspekts ir datu pārvaldība. Tiek uzskatīts par nepieciešamu optimizēt pētījumu datu vākšanu, apmaiņu un apstrādi. Šim nolūkam ir ļoti svarīgi izveidot sadarbības datu infrastruktūru un pakalpojumus. Kaizerslauternā, vienā no galvenajām vietām, notiek cieša sadarbība starp bioloģiju un datorzinātnēm, kas atbalsta modernu analīzes un vizualizācijas metožu attīstību.

Inovatīvi projekti un attīstība

DataPLANT konsorcijs aktīvi iesaistās dažādos projektos. Piemēram, 2025. gada 26. maijā tika paziņots, ka CEPLAS konsorcijs ir nodrošinājis finansējumu savai trešajai kārtai, būtiski paplašinot augu izpētes iespējas. GreenRobust, kas ir daļa no DataPLANT, arī tika izvēlēts kā izcilības klasteris. Tas parāda konsorcija vērtīgo lomu Vācijas mēroga pētniecības infrastruktūrā. Apmaiņa un sadarbība ar citiem NFDI konsorcijiem, piemēram, NFDI4BIOIMAGE, uzsver apņemšanos izstrādāt elastīgus risinājumus datu pārvaldībai, piemēram, VDI un DaaS risinājumu, kas tika prezentēts 2025. gada 13. aprīlī. Tas tika tālāk apspriests simpozijā Potsdamā 2025. gada 4. aprīlī.

DataPLANT tika prezentēts arī 2025. gada 16. maijā pētniecības datu pārvaldības kolokvija ietvaros Erlangenas-Nirnbergas Universitātē. Konsorcija pamatmērķi tika izskatīti sīkāk.

FAIR datu glabāšana un AI integrācija

Vēl viens pašreizējo pētījumu aspekts ir diskusija par mākslīgo intelektu (AI) un tā integrāciju datu pārvaldības procesos. AI izmantošana galvenokārt tiek uzskatīta par iespēju, taču ir brīdinājuma balsis par modeļu un piedāvājumu pārvērtēšanu. Šajā kontekstā tiek prezentēta jaunā IT sistēma VERDA, kas tika izstrādāta īpaši Transregio Collaborative Research Center TRR365 vajadzībām. VERDA nodrošina pētījumu datu uzglabāšanu, koplietošanu un sagatavošanu publicēšanai un integrē sociālos pakalpojumus, piemēram, Matrix tērzēšanas sistēmu.

Minhenes Tehniskā universitāte arī atbalsta projektu ar datu pārvaldnieku FAIR datu pārvaldībai. FAIR nozīmē atrodams, pieejams, sadarbspējīgs un atkārtoti lietojams. Neskatoties uz daudzajām priekšrocībām, FAIR datu glabāšana joprojām ir izaicinājums, jo īpaši ikdienas laboratorijas dzīvē, kur lielu datu kopu apstrāde, piemēram, genoma sekvencēšana un laboratorijas vērtības, ir sarežģīta.

Aktīva dalība DataPLANT konsorcijā, citās NFDI iniciatīvās, piemēram, NFDI4Ing, NFDI4Chem un NFDIxCS, un tādu infrastruktūru kā Kaizerslauternas reģionālā universitātes skaitļošanas centra nodrošināšana nodrošina uz nākotni orientētu augu pētniecības kvalitāti un efektivitāti. The LRZ uzsver, cik svarīga šāda infrastruktūra ir zinātnieku aprindām, lai stātos pretī digitālā laikmeta izaicinājumiem.