Plantenonderzoek van de toekomst: Innovatie door digitaal datamanagement

Plantenonderzoek van de toekomst: Innovatie door digitaal datamanagement

Met als doel het veiligstellen van voedsel voor een groeiende wereldbevolking heeft het DataPLANT-consortium een ​​aanzienlijke invloed op het plantenonderzoek. Dit consortium heeft de taak om enorme hoeveelheden data uit plantenonderzoek bruikbaar en vergelijkbaar te maken. Onderzoekers uit verschillende disciplines werken samen om de genetische diversiteit en moleculaire principes te analyseren die de groei, gewasopbrengst en biomassaproductie bepalen. De financiering werd besloten door de Joint Science Conference (GWK) op aanbeveling van de Duitse Onderzoeksstichting (DFG) tot eind 2028, wat de duurzaamheid en relevantie van de onderzoeken bevestigt. Volgens de RPTU Het onderzoek heeft tot doel het begrip van het plantenleven te verbeteren. Dit gebeurt ook tegen de achtergrond van de mondiale uitdagingen op het gebied van voedselzekerheid.

Een centraal aspect van onderzoek is datamanagement. Het wordt noodzakelijk geacht om de verzameling, uitwisseling en verwerking van onderzoeksdata te optimaliseren. Het opzetten van collaboratieve data-infrastructuren en -diensten is hiervoor cruciaal. In Kaiserslautern, een van de belangrijkste locaties, bestaat er een nauwe samenwerking tussen biologie en informatica, wat de ontwikkeling van moderne analyse- en visualisatiemethoden ondersteunt.

Innovatieve projecten en ontwikkelingen

Het DataPLANT consortium is actief betrokken bij diverse projecten. Op 26 mei 2025 werd bijvoorbeeld aangekondigd dat het CEPLAS-consortium financiering had veiliggesteld voor de derde fase, waardoor de mogelijkheden voor plantenonderzoek aanzienlijk werden uitgebreid. Ook GreenRobust, onderdeel van DataPLANT, werd geselecteerd als cluster van uitmuntendheid. Dit toont de waardevolle rol aan die het consortium speelt in de Duitse onderzoeksinfrastructuur. De uitwisseling en samenwerking met andere NFDI-consortia, zoals NFDI4BIOIMAGE, onderstrepen het commitment om flexibele oplossingen voor datamanagement te ontwikkelen, zoals de VDI- en DaaS-oplossing die op 13 april 2025 werd gepresenteerd. Dit werd verder besproken tijdens een symposium in Potsdam op 4 april 2025.

DataPLANT werd ook gepresenteerd op 16 mei 2025 als onderdeel van een colloquium voor onderzoeksdatamanagement aan de Universiteit van Erlangen-Neurenberg. De kerndoelstellingen van het consortium zijn nader onderzocht.

FAIR dataopslag en AI-integratie

Een ander aspect van het huidige onderzoek is de discussie rond kunstmatige intelligentie (AI) en de integratie ervan in datamanagementprocessen. De inzet van AI wordt vooral gezien als een kans, maar er klinken waarschuwende stemmen over de overwaardering van modellen en aanbiedingen. In deze context wordt het nieuwe IT-systeem VERDA gepresenteerd, dat speciaal is ontwikkeld voor het Transregio Collaborative Research Center TRR365. VERDA maakt het opslaan, delen en voorbereiden van onderzoeksgegevens voor publicatie mogelijk en integreert sociale diensten zoals het Matrix-chatsysteem.

Ook de Technische Universiteit München ondersteunt het project met een datasteward voor FAIR datamanagement. FAIR staat voor Vindbaar, Toegankelijk, Interoperabel en Herbruikbaar. Ondanks de talrijke voordelen blijft FAIR-gegevensopslag een uitdaging, vooral in het dagelijkse laboratoriumleven, waar het verwerken van grote datasets, zoals genoomsequencing en laboratoriumwaarden, complex is.

Actieve deelname aan het DataPLANT-consortium, aan andere NFDI-initiatieven zoals NFDI4Ing, NFDI4Chem en NFDIxCS en het aanbieden van infrastructuren zoals het regionale universitaire rekencentrum in Kaiserslautern zorgen voor toekomstgerichte kwaliteit en efficiëntie in plantenonderzoek. De LRZ benadrukt hoe belangrijk een dergelijke infrastructuur is voor de wetenschappelijke gemeenschap om de uitdagingen van het digitale tijdperk het hoofd te bieden.