Badania roślin przyszłości: Innowacje poprzez cyfrowe zarządzanie danymi

Badania roślin przyszłości: Innowacje poprzez cyfrowe zarządzanie danymi

Mając na celu zapewnienie żywności rosnącej populacji światowej, konsorcjum DataPLANT ma znaczący wpływ na badania nad roślinami. Zadaniem tego konsorcjum jest zapewnienie użyteczności i porównywalności ogromnych ilości danych pochodzących z badań roślin. Naukowcy z różnych dyscyplin współpracują przy analizie różnorodności genetycznej i zasad molekularnych determinujących wzrost, plony i produkcję biomasy. O finansowaniu zdecydowała Wspólna Konferencja Naukowa (GWK) na podstawie rekomendacji Niemieckiej Fundacji Badawczej (DFG) do końca 2028 r., co potwierdza trwałość i zasadność badań. Według RPTU Badania mają na celu lepsze zrozumienie życia roślin. Dzieje się tak także na tle globalnych wyzwań związanych z bezpieczeństwem żywnościowym.

Centralnym aspektem badań jest zarządzanie danymi. Za niezbędną uważa się optymalizację gromadzenia, wymiany i przetwarzania danych badawczych. Kluczowe znaczenie ma w tym celu utworzenie wspólnych infrastruktur i usług danych. W Kaiserslautern, jednej z głównych lokalizacji, istnieje ścisła współpraca biologii i informatyki, co wspiera rozwój nowoczesnych metod analizy i wizualizacji.

Innowacyjne projekty i rozwiązania

Konsorcjum DataPLANT aktywnie uczestniczy w różnorodnych projektach. Na przykład 26 maja 2025 r. ogłoszono, że konsorcjum CEPLAS zabezpieczyło finansowanie trzeciej fazy, znacznie poszerzając możliwości badań nad roślinami. Jako klaster doskonałości wybrano także GreenRobust, część DataPLANT. Pokazuje to cenną rolę, jaką konsorcjum odgrywa w ogólnoniemieckiej infrastrukturze badawczej. Wymiana i współpraca z innymi konsorcjami NFDI, takimi jak NFDI4BIOIMAGE, podkreślają zaangażowanie w rozwój elastycznych rozwiązań do zarządzania danymi, takich jak rozwiązanie VDI i DaaS zaprezentowane 13 kwietnia 2025 r. Było to szerzej omawiane na sympozjum w Poczdamie 4 kwietnia 2025 r.

DataPLANT został również zaprezentowany 16 maja 2025 r. w ramach kolokwium dotyczącego zarządzania danymi badawczymi na Uniwersytecie Erlangen-Norymberga. Podstawowe cele konsorcjum zostały zbadane bardziej szczegółowo.

Przechowywanie danych FAIR i integracja AI

Kolejnym aspektem bieżących badań jest dyskusja wokół sztucznej inteligencji (AI) i jej integracji z procesami zarządzania danymi. Wykorzystanie sztucznej inteligencji postrzegane jest przede wszystkim jako szansa, pojawiają się jednak głosy ostrzegające przed przewartościowaniem modeli i ofert. W tym kontekście zaprezentowano nowy system informatyczny VERDA, który został opracowany specjalnie dla Transregio Collaborative Research Centre TRR365. VERDA umożliwia przechowywanie, udostępnianie i przygotowanie danych badawczych do publikacji oraz integruje usługi społecznościowe, takie jak system chat Matrix.

Uniwersytet Techniczny w Monachium również wspiera projekt, zatrudniając administratora danych do zarządzania danymi FAIR. FAIR oznacza „możliwy do znalezienia, dostępny, interoperacyjny i wielokrotnego użytku”. Pomimo licznych zalet przechowywanie danych FAIR pozostaje wyzwaniem, szczególnie w codziennym życiu laboratoryjnym, gdzie przetwarzanie dużych zbiorów danych, takich jak sekwencjonowanie genomu i wartości laboratoryjne, jest złożone.

Aktywny udział w konsorcjum DataPLANT, w innych inicjatywach NFDI, takich jak NFDI4Ing, NFDI4Chem i NFDIxCS oraz zapewnienie infrastruktury, takiej jak regionalne uniwersyteckie centrum obliczeniowe w Kaiserslautern, zapewniają przyszłościową jakość i wydajność w badaniach nad roślinami. The LRZ podkreśla, jak ważna jest taka infrastruktura dla społeczności naukowej, aby sprostać wyzwaniom ery cyfrowej.