Rastlinný výskum budúcnosti: Inovácia prostredníctvom správy digitálnych dát

Rastlinný výskum budúcnosti: Inovácia prostredníctvom správy digitálnych dát

S cieľom zabezpečiť potraviny pre rastúcu globálnu populáciu má konzorcium DataPLANT významný vplyv na výskum rastlín. Toto konzorcium má za úlohu sprístupniť a porovnať obrovské množstvo údajov z výskumu rastlín. Výskumníci z rôznych odborov spolupracujú na analýze genetickej diverzity a molekulárnych princípov, ktoré určujú rast, výnos plodín a produkciu biomasy. O financovaní rozhodla Spoločná vedecká konferencia (GWK) na odporúčanie Nemeckej výskumnej nadácie (DFG) do konca roku 2028, čo potvrdzuje udržateľnosť a relevantnosť štúdií. Podľa RPTU Cieľom výskumu je zlepšiť pochopenie života rastlín. Deje sa tak aj na pozadí globálnych výziev potravinovej bezpečnosti.

Ústredným aspektom výskumu je správa údajov. Považuje sa za potrebné optimalizovať zber, výmenu a spracovanie výskumných údajov. Na to je kľúčové zriadenie kolaboratívnych dátových infraštruktúr a služieb. V Kaiserslauterne, jednom z hlavných miest, existuje úzka spolupráca medzi biológiou a počítačovou vedou, čo podporuje rozvoj moderných metód analýzy a vizualizácie.

Inovatívne projekty a vývoj

Konzorcium DataPLANT sa aktívne zapája do rôznych projektov. Napríklad 26. mája 2025 bolo oznámené, že konzorcium CEPLAS zabezpečilo financovanie svojej tretej fázy, čím sa výrazne rozšírili možnosti výskumu rastlín. GreenRobust, súčasť DataPLANT, bol tiež vybraný ako klaster excelentnosti. To ukazuje cennú úlohu, ktorú konzorcium zohráva v celonemeckej výskumnej infraštruktúre. Výmena a spolupráca s ďalšími konzorciami NFDI, ako je NFDI4BIOIMAGE, podčiarkujú záväzok vyvíjať flexibilné riešenia pre správu údajov, ako je riešenie VDI a DaaS predstavené 13. apríla 2025. Ďalej sa o tom diskutovalo na sympóziu v Postupime 4. apríla 2025.

DataPLANT bol predstavený aj 16. mája 2025 v rámci kolokvia o manažmente výskumných údajov na Univerzite v Erlangene-Norimbergu. Hlavné ciele konzorcia boli preskúmané podrobnejšie.

FAIR ukladanie dát a integrácia AI

Ďalším aspektom súčasného výskumu je diskusia o umelej inteligencii (AI) a jej integrácii do procesov správy dát. Využitie AI je vnímané predovšetkým ako príležitosť, no ozývajú sa varovné hlasy týkajúce sa nadhodnotenia modelov a ponúk. V tejto súvislosti je predstavený nový IT systém VERDA, ktorý bol vyvinutý špeciálne pre Transregio Collaborative Research Center TRR365. VERDA umožňuje ukladanie, zdieľanie a prípravu výskumných dát na publikovanie a integruje sociálne služby, ako je chatovací systém Matrix.

Technická univerzita v Mníchove podporuje projekt aj správcom údajov pre FAIR správu údajov. FAIR je skratka pre Findable, Accessible, Interoperable a Reusable. Napriek mnohým výhodám zostáva uchovávanie údajov FAIR výzvou, najmä v každodennom laboratórnom živote, kde je zložité spracovanie veľkých súborov údajov, ako je sekvenovanie genómu a laboratórne hodnoty.

Aktívna účasť v konzorciu DataPLANT, v ďalších iniciatívach NFDI, ako sú NFDI4Ing, NFDI4Chem a NFDIxCS a poskytovanie infraštruktúr, ako je regionálne univerzitné výpočtové centrum v Kaiserslauterne, zabezpečujú kvalitu a efektívnosť výskumu rastlín orientovanú na budúcnosť. The LRZ zdôrazňuje, aká dôležitá je takáto infraštruktúra pre vedeckú komunitu, aby mohla čeliť výzvam digitálneho veku.