Mikrobioomid ja nematoodid: kuidas keskkond elu mõjutab!
Kieli koostööuuringute keskus uurib Caenorhabditis elegansi mikrobioomi ja selle keskkonnamõjusid. Lisateavet selle uuendusliku uurimistöö kohta Kieli ülikoolis.

Mikrobioomid ja nematoodid: kuidas keskkond elu mõjutab!
Bakteritest, viirustest ja seentest koosneval mikrobioomil on paljurakuliste organismide tervisele kaugeleulatuv mõju. See mängib olulist rolli toidu kasutamisel ja kaitseb patogeenide eest. Selle mikroobse ökosüsteemi häireid on seostatud paljude haigustega. Kieli Christian Albrechtsi ülikooli Kieli koostööuuringute keskuse (SFB) 1182 praegune uuring uurib peremeesorganismide ja nende mikrobioomide vahelisi keerulisi koostoimeid. Valju Kieli ülikool Uuring näitab, kuidas organismi mikrobioom ja selle mikroobne keskkond mõjutavad vastastikku.
Uurimistöö keskmes on perekonna nematoodidCaenorhabditis, eriti tavaliselt kasutatav mudelorganismC. elegans. Need organismid annavad väärtuslikku teavet bioloogiliste protsesside kohta, kuna neil ei ole ühtlast mikrobioomi koostist, kuid nad on väga individuaalsed ja sõltuvad oma keskkonnast.
Õpitulemused ja metoodika
Uuring umbesC. elegansanalüüsis kahe aasta jooksul vaadeldud kompostihunnikut, et võrrelda usside ja õunte mikrobiome. Selgus, et nematoodi mikrobioomi mõjutab oluliselt substraat, millel ta elab. Konkreetsest õunast pärinevate usside mikrobioomid erinevad oluliselt teiste substraatide omadest. See viitab sellele, et selle jaoks puudub kindel "tuummikrobioom".C. eleganssest koostis on väga erinev isegi ühest õunast pärit usside vahel.
Uuringu teine huvitav aspekt on "levitamise piiramise" mõju. See väidab, et ussi mikrobioom sõltub suuresti tema lähikeskkonnast. Ainevahetusanalüüsid näitasid, et nematoodid võivad mõjutada ka õunte mikroobset koostist ja ainevahetusprotsesse. On isegi oletatud, et olemasoluC. eleganskas muutusid õunte ainevahetusprotsessid või et ussid eelistavad küpsemaid õunu.
asjakohasusC. elegans
C. elegansSydney Brenner arendas selle üle 50 aasta tagasi geneetilise mudelina ja sellest ajast on saanud asendamatu vahend arengu- ja neurobioloogias. Kuna vastsete staadiumis on väike, vaid 0,25 mm suurune ja kolm päeva kestev kiire elutsükkel munast täiskasvanud ussideni, uuritakse seda intensiivselt enam kui 1000 laboris üle maailma. Aastas avaldatakse üle 1200 teadusartikli, mis hõlmavad erinevaid bioloogia aspekte, alates eukarüootsete rakkude funktsioonidest kuni inimorganismi vastasmõjudeni, nagu näiteks NCBI näitab.
Geneetilised manipulatsioonidC. eleganson eriti tõhusad tänu oma hästi annoteeritud genoomile ja võimalusele rakendada nii päri- kui ka pöördgeneetikat. See võimaldab üksikasjalikke uuringuid organismi ja raku tasandil.C. eleganson esimene mitmerakuline organism, mille genoom on järjestatud, mis rõhutab selle olulisust inimeste meditsiiniuuringutes.
Tihe seos mikrobioomi vahelC. elegansja selle keskkond avab uusi perspektiive uurimaks mikroobikoosluste mõju peremeesorganismile. Tulevased uuringud keskenduvad tõenäoliselt genoomi redigeerimisele ja regulatiivsete RNA-de rollile. Need arengud võivad anda uusi teadmisi peremeesorganismide bioloogilistest funktsioonidest ja pikaajalisest tervisest, uurides samal ajal mikrobioomide ja peremeesorganismide vahelist sünergiat.