Microbiomes et nématodes : Comment l’environnement influence la vie !

Microbiomes et nématodes : Comment l’environnement influence la vie !

Le microbiome, composé de bactéries, de virus et de champignons, a des effets considérables sur la santé des organismes multicellulaires. Il joue un rôle essentiel dans l’utilisation des aliments et protège contre les agents pathogènes. La perturbation de cet écosystème microbien a été associée à de nombreuses maladies. Une étude actuelle du Kiel Collaborative Research Center (SFB) 1182 de l'Université Christian Albrechts de Kiel étudie les interactions complexes entre les organismes hôtes et leurs microbiomes. Fort Université de Kiel L'étude montre comment le microbiome d'un organisme et son environnement microbien s'influencent mutuellement.

La recherche se concentre sur le nématode du genreCaénorhabdite, en particulier l'organisme modèle couramment utiliséC. elegans. Ces organismes fournissent des informations précieuses sur les processus biologiques, car ils n’ont pas une composition microbiologique uniforme, mais sont très individuels et dépendants de leur environnement.

Résultats de l'étude et méthodologie

L'étude surC. elegansanalysé un tas de compost observé pendant deux ans pour comparer les microbiomes des vers et des pommes. Il s’est avéré que le microbiome du nématode est fortement influencé par le substrat sur lequel il vit. Les microbiomes des vers dérivés d’une pomme particulière diffèrent considérablement de ceux d’autres substrats. Cela suggère qu’il n’existe pas de « microbiome central » fixe pourC. eleganscar la composition varie considérablement même entre les vers d'une même pomme.

Un autre aspect intéressant de l’étude est l’effet de « limitation de la dispersion ». Cela indique que le microbiome du ver dépend fortement de son environnement immédiat. Les analyses du métabolisme ont montré que les nématodes peuvent également influencer la composition microbienne et les processus métaboliques des pommes. On suppose même que la présence deC. eleganssoit les processus métaboliques des pommes ont changé, soit les vers préfèrent les pommes plus mûres.

La pertinence deC. elegans

C. elegansa été développé il y a plus de 50 ans par Sydney Brenner comme modèle génétique et est depuis devenu un outil indispensable en développement et en neurobiologie. Avec une petite taille de seulement 0,25 mm au stade larvaire et un cycle de vie rapide de trois jours, de l'œuf au ver adulte, il fait l'objet de recherches intensives dans plus de 1 000 laboratoires à travers le monde. Plus de 1 200 articles de recherche sont publiés chaque année, couvrant divers aspects de la biologie, depuis les fonctions des cellules eucaryotes jusqu'aux interactions homme-organisme, telles que NCBI montre.

Les manipulations génétiquesC. eleganssont particulièrement efficaces en raison de leur génome bien annoté et de leur capacité à appliquer à la fois la génétique directe et inverse. Cela permet des études détaillées aux niveaux organique et cellulaire.C. elegansest le premier organisme multicellulaire dont le génome a été séquencé, soulignant ainsi sa pertinence pour la recherche médicale humaine.

Le lien étroit entre le microbiome deC. eleganset son environnement ouvrent de nouvelles perspectives pour la recherche sur les effets des communautés microbiennes sur l'hôte. Les études futures se concentreront probablement sur l’édition du génome et le rôle des ARN régulateurs. Ces développements pourraient conduire à de nouvelles connaissances sur les fonctions biologiques et la santé à long terme des organismes hôtes, tout en explorant davantage la synergie entre les microbiomes et les organismes hôtes.