PLANT DataHUB: Revoluce ve správě výzkumných dat pro rostlinné vědce!

PLANT DataHUB: Revoluce ve správě výzkumných dat pro rostlinné vědce!

Za posledních pět let se PLANT DataHUB etabloval jako centrální platforma pro správu výzkumných dat v oblasti rostlinných věd. Hlasitý uni-freiburg.de Tato platforma umožňuje integraci moderních workflow systémů jako je Galaxy a nabízí přímou možnost publikace dat. Tento vývoj je významný, protože podporuje vědce v jejich výzkumných projektech tím, že jim umožňuje efektivně spravovat celý životní cyklus dat.

PLANT DataHUB nabízí možnost registrace dat, která jsou organizována v tzv. Annotated Research Contexts (ARC). Tyto digitální objekty jsou považovány za osvědčené postupy pro ukládání rostlinných dat a jsou navrženy podle principů Findable, Accessible, Interoperable and Reproducible (FAIR), jako je např. plantae.org hlášeno. To podporuje transparentní a efektivní správu dat, která je nezbytná pro vědecký pokrok ve výzkumu rostlin.

Mezioborová spolupráce

Dr. Dirk von Suchodoletz z počítačového centra na univerzitě ve Freiburgu působí jako mluvčí společnosti DataPLANT. Tato iniciativa spojuje výzkumníky z různých oborů, aby analyzovali genetickou rozmanitost a evoluci rostlin. Zatímco shromážděná data jsou často zpracovávána pomocí počítače, je také evidentní potřeba efektivního managementu výzkumných dat (RDM). nfdi.de se objeví.

Před zavedením PLANT DataHUB Německo postrádalo celostátně koordinovanou infrastrukturu pro správu výzkumných dat. DataPLANT si klade za cíl odstranit tuto mezeru a podporovat mezioborovou výměnu odborných znalostí. Cílem konsorcia je podporovat demokratizaci výzkumných dat a rozšířit dosah interdisciplinárních přístupů ve výzkumu rostlin.

Výzkum a správa dat

Nové nástroje a platformy vyvinuté v rámci iniciativy DataPLANT jsou praktické a podporují výměnu a spolupráci mezi vědci. Platforma podporuje efektivní využití vysoce výkonných metod pro generování velkého množství dat z oblastí, jako je genomika a transkriptomika.

Cloudová platforma PLANTdataHUB zajišťuje nejen výměnu a publikování dat, ale také kolaborativní správu dat. DataPLANT také podporuje aktivní komunitu podporovanou školicími aktivitami a průvodcem plánem správy dat. Cílem je široká účast, která se zaměřuje na interoperabilitu a integraci existujících souborů dat.

Stručně řečeno, je vidět, že vývoj PLANT DataHUB a konsorcia DataPLANT představuje významný pokrok pro výzkum rostlin v Německu a pokládá základy pro efektivnější a transparentnější správu dat.