PLANT DataHUB: Επανάσταση στη διαχείριση ερευνητικών δεδομένων για επιστήμονες φυτών!

PLANT DataHUB: Επανάσταση στη διαχείριση ερευνητικών δεδομένων για επιστήμονες φυτών!

Τα τελευταία πέντε χρόνια, το PLANT DataHUB έχει καθιερωθεί ως κεντρική πλατφόρμα για τη διαχείριση ερευνητικών δεδομένων στον τομέα των φυτοεπιστημών. Μεγαλόφωνος uni-freiburg.de Αυτή η πλατφόρμα επιτρέπει την ενσωμάτωση σύγχρονων συστημάτων ροής εργασίας όπως το Galaxy και προσφέρει μια άμεση επιλογή για δημοσίευση δεδομένων. Αυτές οι εξελίξεις είναι σημαντικές γιατί υποστηρίζουν τους επιστήμονες στα ερευνητικά τους έργα, επιτρέποντάς τους να διαχειρίζονται αποτελεσματικά ολόκληρο τον κύκλο ζωής των δεδομένων.

Το PLANT DataHUB προσφέρει τη δυνατότητα καταχώρισης δεδομένων που είναι οργανωμένα στα λεγόμενα Annotated Research Contexts (ARCs). Αυτά τα ψηφιακά αντικείμενα θεωρούνται βέλτιστες πρακτικές για την αποθήκευση δεδομένων εγκαταστάσεων και έχουν σχεδιαστεί σύμφωνα με τις αρχές Findable, Accessible, Interoperable and Reproducible (FAIR), όπως π.χ. plantae.org αναφέρθηκε. Αυτό προάγει τη διαφανή και αποτελεσματική διαχείριση δεδομένων, η οποία είναι απαραίτητη για την επιστημονική πρόοδο στην έρευνα των φυτών.

Διεπιστημονική συνεργασία

Ο Δρ Dirk von Suchodoletz από το κέντρο υπολογιστών στο Πανεπιστήμιο του Φράιμπουργκ ενεργεί ως εκπρόσωπος της DataPLANT. Αυτή η πρωτοβουλία συγκεντρώνει ερευνητές από διαφορετικούς κλάδους για να αναλύσουν τη γενετική ποικιλότητα και την εξέλιξη των φυτών. Ενώ τα δεδομένα που συλλέγονται συχνά υποβάλλονται σε επεξεργασία με τη βοήθεια υπολογιστή, η ανάγκη για αποτελεσματική διαχείριση ερευνητικών δεδομένων (RDM) είναι επίσης εμφανής nfdi.de αναδύεται.

Πριν από την εισαγωγή του PLANT DataHUB, η Γερμανία δεν είχε μια εθνικά συντονισμένη υποδομή για τη διαχείριση ερευνητικών δεδομένων. Το DataPLANT στοχεύει να κλείσει αυτό το κενό και να προωθήσει τη διεπιστημονική ανταλλαγή εμπειρογνωμοσύνης. Η κοινοπραξία στοχεύει να υποστηρίξει τον εκδημοκρατισμό των ερευνητικών δεδομένων και να επεκτείνει την εμβέλεια των διεπιστημονικών προσεγγίσεων στην έρευνα των φυτών.

Έρευνα και διαχείριση δεδομένων

Τα νέα εργαλεία και πλατφόρμες που αναπτύχθηκαν στο πλαίσιο της πρωτοβουλίας DataPLANT είναι πρακτικά και προωθούν την ανταλλαγή και τη συνεργασία μεταξύ των επιστημόνων. Η πλατφόρμα υποστηρίζει την αποτελεσματική χρήση μεθόδων υψηλής απόδοσης για τη δημιουργία μεγάλων ποσοτήτων δεδομένων από τομείς όπως η γονιδιωματική και η μεταγραφική.

Η πλατφόρμα cloud PLANTdataHUB εξασφαλίζει όχι μόνο ανταλλαγή και δημοσίευση δεδομένων, αλλά και συλλογική διαχείριση δεδομένων. Το DataPLANT προωθεί επίσης μια ενεργή κοινότητα που υποστηρίζεται από εκπαιδευτικές δραστηριότητες και έναν οδηγό σχεδίου διαχείρισης δεδομένων. Στόχος είναι η ευρεία συμμετοχή που εστιάζει στη διαλειτουργικότητα και την ενοποίηση των υφιστάμενων συνόλων δεδομένων.

Συνοπτικά, μπορεί να φανεί ότι η ανάπτυξη του PLANT DataHUB και της κοινοπραξίας DataPLANT αντιπροσωπεύει σημαντική πρόοδο για την έρευνα φυτών στη Γερμανία και θέτει τα θεμέλια για πιο αποτελεσματική και διαφανή διαχείριση δεδομένων.