PLANT DataHUB: revolutsioon taimeteadlaste uurimisandmete haldamises!
PLANT DataHUBiga käivitab Freiburgi Ülikool uuendusliku platvormi taimeuuringute andmete haldamiseks.

PLANT DataHUB: revolutsioon taimeteadlaste uurimisandmete haldamises!
Viimase viie aasta jooksul on PLANT DataHUB end tõestanud taimeteaduste valdkonna uurimisandmete haldamise keskse platvormina. Valju uni-freiburg.de See platvorm võimaldab integreerida kaasaegseid töövoosüsteeme nagu Galaxy ja pakub otsest võimalust andmete avaldamiseks. Need arengud on olulised, kuna need toetavad teadlasi nende uurimisprojektides, võimaldades neil tõhusalt hallata kogu andmete elutsüklit.
PLANT DataHUB pakub võimalust registreerida andmeid, mis on korraldatud niinimetatud Annotated Research Contexts (ARC) abil. Neid digitaalseid objekte peetakse tehase andmete salvestamise parimateks tavadeks ja need on kujundatud vastavalt leitava, juurdepääsetava, koostalitlusvõimelise ja reprodutseeritava (FAIR) põhimõtetele, nagu näiteks plantae.org teatatud. See soodustab läbipaistvat ja tõhusat andmehaldust, mis on taimeuuringute teaduse arengu jaoks hädavajalik.
Interdistsiplinaarne koostöö
Dr Dirk von Suchodoletz Freiburgi ülikooli arvutikeskusest tegutseb DataPLANTi pressiesindajana. See algatus koondab erinevate teadusharude teadlasi, et analüüsida geneetilist mitmekesisust ja taimede arengut. Kuigi kogutud andmeid töödeldakse sageli arvuti abil, on ilmne ka vajadus tõhusa teadusandmete haldamise (RDM) järele. nfdi.de ilmneb.
Enne PLANT DataHUBi kasutuselevõttu puudus Saksamaal riiklikult koordineeritud infrastruktuur teadusandmete haldamiseks. DataPLANTi eesmärk on see lünk kaotada ja edendada interdistsiplinaarset ekspertteadmiste vahetust. Konsortsiumi eesmärk on toetada uurimisandmete demokratiseerimist ja laiendada interdistsiplinaarsete lähenemisviiside haaret taimeuuringutes.
Uuringud ja andmehaldus
DataPLANT algatuse raames välja töötatud uued tööriistad ja platvormid on praktilised ning soodustavad teadlaste vahelist vahetust ja koostööd. Platvorm toetab suure läbilaskevõimega meetodite tõhusat kasutamist, et genereerida suurtes kogustes andmeid sellistest valdkondadest nagu genoomika ja transkriptoomika.
Pilveplatvorm PLANTdataHUB tagab mitte ainult andmevahetuse ja avaldamise, vaid ka koostööpõhise andmehalduse. DataPLANT edendab ka aktiivset kogukonda, mida toetavad koolitustegevused ja andmehaldusplaani viisard. Eesmärk on laialdane osalemine, mis keskendub koostalitlusvõimele ja olemasolevate andmekogumite integreerimisele.
Kokkuvõttes on näha, et PLANT DataHUBi ja DataPLANT konsortsiumi arendamine kujutab endast olulist edasiminekut Saksamaa taimeuuringutes ning paneb aluse tõhusamale ja läbipaistvamale andmehaldusele.