PLANT DataHUB: Vallankumous kasvien tutkijoiden tutkimustiedonhallinnassa!

PLANT DataHUB: Vallankumous kasvien tutkijoiden tutkimustiedonhallinnassa!

PLANT DataHUB on viimeisen viiden vuoden aikana vakiinnuttanut asemansa keskeisenä alustana kasvitieteiden alan tutkimusdatan hallinnassa. äänekäs uni-freiburg.de Tämä alusta mahdollistaa nykyaikaisten työnkulkujärjestelmien, kuten Galaxyn, integroinnin ja tarjoaa suoran vaihtoehdon tietojen julkaisemiseen. Nämä kehityssuunnat ovat merkittäviä, koska ne tukevat tutkijoita heidän tutkimusprojekteissaan antamalla heille mahdollisuuden hallita tehokkaasti koko datan elinkaarta.

PLANT DataHUB tarjoaa mahdollisuuden rekisteröidä tietoja, jotka on järjestetty niin kutsuttuihin Annotated Research Contexts (ARC) -konteksteihin. Näitä digitaalisia objekteja pidetään parhaina käytäntöinä laitostietojen tallentamiseen, ja ne on suunniteltu Findable, Accessible, Interoperable and Reproducible (FAIR) -periaatteiden mukaisesti, kuten esim. plantae.org raportoitu. Tämä edistää läpinäkyvää ja tehokasta tiedonhallintaa, joka on olennaista kasvitutkimuksen tieteelliselle edistymiselle.

Tieteidenvälistä yhteistyötä

Tohtori Dirk von Suchodoletz Freiburgin yliopiston tietokonekeskuksesta toimii DataPLANTin tiedottajana. Tämä aloite kokoaa yhteen eri alojen tutkijoita analysoimaan geneettistä monimuotoisuutta ja kasvien evoluutiota. Vaikka kerätyt tiedot käsitellään usein tietokoneavusteisesti, tehokkaan tutkimusdatan hallinnan (RDM) tarve on myös ilmeinen. nfdi.de tulee esiin.

Ennen PLANT DataHUBin käyttöönottoa Saksasta puuttui kansallisesti koordinoitu infrastruktuuri tutkimusdatan hallintaan. DataPLANT pyrkii kuromaan umpeen tätä aukkoa ja edistämään tieteidenvälistä asiantuntemuksen vaihtoa. Konsortion tavoitteena on tukea tutkimusaineiston demokratisoitumista ja laajentaa monitieteisten lähestymistapojen ulottuvuutta kasvitutkimuksessa.

Tutkimus ja tiedonhallinta

DataPLANT-aloitteessa kehitetyt uudet työkalut ja alustat ovat käytännöllisiä ja edistävät tutkijoiden välistä vaihtoa ja yhteistyötä. Alusta tukee korkean suorituskyvyn menetelmien tehokasta käyttöä suurten tietomäärien tuottamiseksi sellaisilta alueilta kuin genomiikka ja transkriptomiikka.

PLANTdataHUB-pilvialusta varmistaa tiedonvaihdon ja julkaisemisen lisäksi myös yhteisen tiedonhallinnan. DataPLANT edistää myös aktiivista yhteisöä, jota tukee koulutustoiminta ja ohjattu tiedonhallintasuunnitelma. Tavoitteena on laaja osallistuminen, joka keskittyy yhteentoimivuuteen ja olemassa olevien tietokokonaisuuksien integrointiin.

Yhteenvetona voidaan todeta, että PLANT DataHUBin ja DataPLANT-konsortion kehittäminen edustaa merkittävää edistystä Saksan tehdastutkimukselle ja luo pohjan tehokkaammalle ja läpinäkyvämmälle tiedonhallinnalle.