PLANT DataHUB : Révolution dans la gestion des données de recherche pour les phytologues !

PLANT DataHUB : Révolution dans la gestion des données de recherche pour les phytologues !

Au cours des cinq dernières années, le PLANT DataHUB s'est imposé comme une plateforme centrale de gestion des données de recherche dans le domaine des sciences végétales. Fort uni-freiburg.de Cette plateforme permet l'intégration de systèmes de flux de travail modernes tels que Galaxy et offre une option directe pour la publication de données. Ces développements sont significatifs car ils accompagnent les scientifiques dans leurs projets de recherche en leur permettant de gérer efficacement l’ensemble du cycle de vie des données.

Le PLANT DataHUB offre la possibilité d'enregistrer des données organisées dans ce que l'on appelle des contextes de recherche annotés (ARC). Ces objets numériques sont considérés comme des bonnes pratiques en matière de stockage de données végétales et sont conçus selon les principes Findable, Accessible, Interoperable and Reproductible (FAIR), tels que plantae.org signalé. Cela favorise une gestion transparente et efficace des données, essentielle au progrès scientifique dans la recherche sur les plantes.

Collaboration interdisciplinaire

Le Dr Dirk von Suchodoletz du centre informatique de l'Université de Fribourg est le porte-parole de DataPLANT. Cette initiative rassemble des chercheurs de différentes disciplines pour analyser la diversité génétique et l'évolution des plantes. Même si les données collectées sont souvent traitées par ordinateur, la nécessité d'une gestion efficace des données de recherche (GDR) est également évidente. nfdi.de émerge.

Avant l’introduction du PLANT DataHUB, l’Allemagne ne disposait pas d’une infrastructure coordonnée au niveau national pour la gestion des données de recherche. DataPLANT vise à combler cette lacune et à promouvoir l’échange interdisciplinaire d’expertise. Le consortium vise à soutenir la démocratisation des données de recherche et à élargir la portée des approches interdisciplinaires dans la recherche sur les plantes.

Recherche et gestion des données

Les nouveaux outils et plateformes développés dans le cadre de l'initiative DataPLANT sont pratiques et favorisent l'échange et la collaboration entre scientifiques. La plateforme prend en charge l'utilisation efficace de méthodes à haut débit pour générer de grandes quantités de données dans des domaines tels que la génomique et la transcriptomique.

La plateforme cloud PLANTdataHUB assure non seulement l'échange et la publication de données, mais également la gestion collaborative des données. DataPLANT favorise également une communauté active soutenue par des activités de formation et un assistant de plan de gestion des données. L’objectif est une large participation axée sur l’interopérabilité et l’intégration des ensembles de données existants.

En résumé, on peut constater que le développement du PLANT DataHUB et du consortium DataPLANT représente un progrès significatif pour la recherche sur les plantes en Allemagne et jette les bases d'une gestion des données plus efficace et plus transparente.