PLANT DataHUB: rivoluzione nella gestione dei dati di ricerca per scienziati vegetali!

PLANT DataHUB: rivoluzione nella gestione dei dati di ricerca per scienziati vegetali!

Negli ultimi cinque anni PLANT DataHUB si è affermato come piattaforma centrale per la gestione dei dati di ricerca nel campo delle scienze vegetali. Forte uni-freiburg.de Questa piattaforma consente l'integrazione di moderni sistemi di flusso di lavoro come Galaxy e offre un'opzione diretta per la pubblicazione dei dati. Questi sviluppi sono significativi perché supportano gli scienziati nei loro progetti di ricerca consentendo loro di gestire in modo efficiente l’intero ciclo di vita dei dati.

PLANT DataHUB offre la possibilità di registrare dati organizzati nei cosiddetti Contesti di ricerca annotati (ARC). Questi oggetti digitali sono considerati best practice per l'archiviazione dei dati dell'impianto e sono progettati secondo i principi Findable, Accessible, Interoperable and Reproducible (FAIR), come plantae.org riportato. Ciò promuove una gestione trasparente ed efficace dei dati, essenziale per il progresso scientifico nella ricerca sulle piante.

Collaborazione interdisciplinare

Il portavoce di DataPLANT è il Dr. Dirk von Suchodoletz del centro di calcolo dell'Università di Friburgo. Questa iniziativa riunisce ricercatori di diverse discipline per analizzare la diversità genetica e l'evoluzione delle piante. Sebbene i dati raccolti vengano spesso elaborati con l’ausilio del computer, è evidente anche la necessità di un’efficace gestione dei dati di ricerca (RDM). nfdi.de emerge.

Prima dell’introduzione del PLANT DataHUB, la Germania non disponeva di un’infrastruttura coordinata a livello nazionale per la gestione dei dati di ricerca. DataPLANT mira a colmare questa lacuna e promuovere lo scambio interdisciplinare di competenze. Il consorzio mira a sostenere la democratizzazione dei dati di ricerca ed espandere la portata degli approcci interdisciplinari nella ricerca sulle piante.

Ricerca e gestione dei dati

I nuovi strumenti e piattaforme sviluppati nell'ambito dell'iniziativa DataPLANT sono pratici e promuovono lo scambio e la collaborazione tra gli scienziati. La piattaforma supporta l'uso efficiente di metodi ad alto rendimento per generare grandi quantità di dati da aree quali la genomica e la trascrittomica.

La piattaforma cloud PLANTdataHUB garantisce non solo lo scambio e la pubblicazione dei dati, ma anche la gestione collaborativa dei dati. DataPLANT promuove inoltre una comunità attiva supportata da attività di formazione e da una procedura guidata per il piano di gestione dei dati. L’obiettivo è un’ampia partecipazione focalizzata sull’interoperabilità e sull’integrazione dei set di dati esistenti.

In sintesi, si può vedere che lo sviluppo del PLANT DataHUB e del consorzio DataPLANT rappresenta un progresso significativo per la ricerca sulle piante in Germania e getta le basi per una gestione dei dati più efficiente e trasparente.