PLANT DataHUB: revolūcija pētījumu datu pārvaldībā augu zinātniekiem!

PLANT DataHUB: revolūcija pētījumu datu pārvaldībā augu zinātniekiem!

Pēdējo piecu gadu laikā PLANT DataHUB ir nostiprinājies kā centrālā platforma pētījumu datu pārvaldībai augu zinātņu jomā. Skaļi uni-freiburg.de Šī platforma ļauj integrēt modernas darbplūsmas sistēmas, piemēram, Galaxy, un piedāvā tiešu datu publicēšanas iespēju. Šīs norises ir nozīmīgas, jo tās atbalsta zinātniekus viņu pētniecības projektos, ļaujot viņiem efektīvi pārvaldīt visu datu dzīves ciklu.

PLANT DataHUB piedāvā iespēju reģistrēt datus, kas ir sakārtoti tā sauktajos anotētos pētījumu kontekstos (ARC). Šie digitālie objekti tiek uzskatīti par augu datu glabāšanas labāko praksi un ir izstrādāti saskaņā ar Findable, Accessible, Interoperable and Reproducible (FAIR) principiem, piemēram, plantae.org ziņots. Tas veicina pārskatāmu un efektīvu datu pārvaldību, kas ir būtiska zinātnes progresam augu izpētē.

Starpdisciplināra sadarbība

Dr. Dirks fon Suchodolecs no Freiburgas Universitātes datoru centra darbojas kā DataPLANT pārstāvis. Šī iniciatīva apvieno dažādu disciplīnu pētniekus, lai analizētu ģenētisko daudzveidību un augu evolūciju. Lai gan savāktie dati bieži tiek apstrādāti ar datoru palīdzību, ir acīmredzama arī nepieciešamība pēc efektīvas pētniecības datu pārvaldības (RDM). nfdi.de parādās.

Pirms PLANT DataHUB ieviešanas Vācijā trūka valsts līmenī koordinētas pētniecības datu pārvaldības infrastruktūras. DataPLANT mērķis ir novērst šo plaisu un veicināt starpdisciplināru zināšanu apmaiņu. Konsorcija mērķis ir atbalstīt pētījumu datu demokratizāciju un paplašināt starpdisciplināru pieeju sasniedzamību augu izpētē.

Pētījumi un datu pārvaldība

Jaunie rīki un platformas, kas izstrādātas iniciatīvas DataPLANT ietvaros, ir praktiski un veicina zinātnieku apmaiņu un sadarbību. Platforma atbalsta augstas caurlaidspējas metožu efektīvu izmantošanu, lai ģenerētu lielu datu apjomu no tādām jomām kā genomika un transkriptomika.

Mākoņplatforma PLANTdataHUB nodrošina ne tikai datu apmaiņu un publicēšanu, bet arī kopīgu datu pārvaldību. DataPLANT arī veicina aktīvu kopienu, ko atbalsta apmācību aktivitātes un datu pārvaldības plāna vednis. Mērķis ir plaša līdzdalība, kas vērsta uz sadarbspēju un esošo datu kopu integrāciju.

Rezumējot, var redzēt, ka PLANT DataHUB un DataPLANT konsorcija attīstība ir nozīmīgs progress augu izpētē Vācijā un liek pamatu efektīvākai un pārskatāmākai datu pārvaldībai.