PLANT DataHUB: Revolúcia v správe výskumných dát pre rastlinných vedcov!

PLANT DataHUB: Revolúcia v správe výskumných dát pre rastlinných vedcov!

Za posledných päť rokov sa PLANT DataHUB etabloval ako centrálna platforma pre správu výskumných dát v oblasti rastlinných vied. nahlas uni-freiburg.de Táto platforma umožňuje integráciu moderných workflow systémov ako Galaxy a ponúka priamu možnosť zverejňovania údajov. Tento vývoj je významný, pretože podporuje vedcov v ich výskumných projektoch tým, že im umožňuje efektívne spravovať celý životný cyklus údajov.

PLANT DataHUB ponúka možnosť registrácie údajov, ktoré sú usporiadané v takzvaných anotovaných výskumných kontextoch (ARC). Tieto digitálne objekty sa považujú za najlepšie postupy na ukladanie údajov o závode a sú navrhnuté podľa princípov Findable, Accessible, Interoperable and Reproducible (FAIR), ako napr. plantae.org nahlásené. To podporuje transparentnú a efektívnu správu údajov, ktorá je nevyhnutná pre vedecký pokrok vo výskume rastlín.

Interdisciplinárna spolupráca

Dr. Dirk von Suchodoletz z výpočtového strediska na univerzite vo Freiburgu pôsobí ako hovorca spoločnosti DataPLANT. Táto iniciatíva spája výskumníkov z rôznych odborov, aby analyzovali genetickú diverzitu a vývoj rastlín. Zatiaľ čo zozbierané údaje sú často spracované pomocou počítača, je evidentná aj potreba efektívneho manažmentu výskumných údajov (RDM). nfdi.de sa objaví.

Pred zavedením PLANT DataHUB v Nemecku chýbala národne koordinovaná infraštruktúra na správu výskumných dát. Cieľom DataPLANT je vyplniť túto medzeru a podporiť interdisciplinárnu výmenu odborných znalostí. Cieľom konzorcia je podporovať demokratizáciu výskumných údajov a rozširovať dosah interdisciplinárnych prístupov vo výskume rastlín.

Výskum a správa údajov

Nové nástroje a platformy vyvinuté v rámci iniciatívy DataPLANT sú praktické a podporujú výmenu a spoluprácu medzi vedcami. Platforma podporuje efektívne využitie vysokovýkonných metód na generovanie veľkého množstva údajov z oblastí ako genomika a transkriptomika.

Cloudová platforma PLANTdataHUB zabezpečuje nielen výmenu a publikovanie dát, ale aj kolaboratívnu správu dát. DataPLANT tiež podporuje aktívnu komunitu podporovanú školiacimi aktivitami a sprievodcom plánom správy údajov. Cieľom je široká účasť, ktorá sa zameriava na interoperabilitu a integráciu existujúcich súborov údajov.

Stručne povedané, je možné vidieť, že vývoj PLANT DataHUB a konzorcia DataPLANT predstavuje významný pokrok pre výskum rastlín v Nemecku a kladie základy pre efektívnejšiu a transparentnejšiu správu dát.